ChEMBLの統合TV製作にケリをつけました。camproj動画ファイルに残り音声をつけたら出力→アップロードできる段階です。 ChEMBLdbは、創薬研究に有用な医薬品化合物の情報を提供するデータベースです。現在、約50万個の化合物情報、約190万件の活性情報及びそ…
ChEMBLの統合TV製作にむけ調査中です。 医薬品/化合物業界の用語やパラメータの意味がようやくひととおりわかるようになってきた感があります。 ChEMBLdbは、創薬研究に有用な医薬品化合物の情報を提供するデータベースです。現在、約50万個の化合物情報、約…
ご無沙汰です。本業に時間を取られまくっていたらすっかり数カ月ぶりの放牧作業です。ChEMBLの統合TV製作にむけ調査を進めています。 医薬品/化合物業界の用語やパラメータの意味が門外漢にはさっぱりでいちいち調べながら作っているので遅々として進まない…
前回でMendeleyの統合TVを完成させたので新しいプロジェクトに取り掛かっています。 標的はニーズ？があったというChEMBL。 ChEMBLdbは、創薬研究に有用な医薬品化合物の情報を提供するデータベースです。現在、約50万個の化合物情報、約190万件の活性情報及…
先日の放牧になりますが統合TV文献管理ソフトMendeleyを使って論文を読む・前編および文献管理ソフトMendeleyを使って論文を読む・後編、アップロードしました。 アップロードした / 文献管理ソフトMendeleyを使って論文を読む・前編 - 統合TV (togotv)(2013…
進捗がストップしているので今回の放牧記録は統合TV内部関係者への事務連絡・報告に近いです。Mendeleyの統合TV、前回までに作った内容（過去記事参照）でMOV出力を 試みました。 が、複数のマシンを使っても製作した動画がMOVに出力できない （エンコーディ…
Mendeleyの統合TV、前回までに作った内容（過去記事参照）で本日ゴーサインを貰えたのでアップロード作業に移行します。 本日は動画のフォントサイズ直しとテンプレート画像付加作業、BGM付け作業だけ。 次回でmovファイル出力にアップロード、とカタをつけ…
統合TV『文献管理ソフトMendeleyで論文を読む（仮題）』、ついにひととおり録画・編集が終わりました。信じられないことに。 ただ最終的に動画が約11分(！！)と統合TVにしては大変な長尺。 2編に分けてアップロードするかも？ 最終的な内容はおよそ以下のと…
作製に終わりがないかに見えたMendeleyの統合TV。録画はなんとすべて終了です。編集は最終段階。 次回の放牧で完成＆アップロードに漕ぎ着けられるかな…？そろそろゴールしたい。。 入れたいコンテンツ収まりきらないよヽ(`Д´)ﾉ 問題は現時点で動画が10分を…
前回のほぼ続き。細切れですが予定どおりの進捗、内容が二転三転しながら進んでいるため撮影と編集を両輪で進めていますが着地点はほぼ定まりました。 残り予想作業時間は10時間程。 [初期設定] -ユーザ登録〜アプリのインストール[文献の追加] -ローカル環…
難産のMendeleyの統合TV、ようやく終わりが見えてきた感があります。 優先的に入れたいコンテンツ部分の動画は入れることができたかなと。現在スピード飛ばし気味で動画を詰めて6分くらい。 見返すとスピードがやや早いなという印象があるので、もうすこしコ…
亀の歩みでMendeleyの統合TV、撮影＆編集を進めています。 進捗は以下のとおり↓ [初期設定] -ユーザ登録〜アプリのインストール[文献の追加] -ローカル環境下の論文の取り込み →公式解説へ -ウェブインポータを介してウェブから論文レファレンスの取り込み →…
こそこそと動画撮影を進めています。 使い方解説動画に入れたいコンテンツがどっさりのMendeleyですが、公式チュートリアル動画も簡単ながら存在し、なんと日本語字幕付きMendeley公式チュートリアル動画もある！と判明したので、ごく基礎的な操作の解説はか…
前回の放牧までで動画の筋書きづくり(動画中の吹き出しの文字部分書き起こし)がほぼ完了したので、動画本編の撮影＆編集を並行で進めています。 おおよその内容は以下のとおりです。 [初期設定] -ユーザ登録〜アプリのインストール[文献の追加] -ローカル環…
ひきつづきMendeleyの使い方解説統合TV作成の計画中です。 動画の筋書きづくりを進めています。【基本機能編】 [初期設定] -ユーザ登録〜アプリのインストール[文献の追加] -ローカル環境下の論文の取り込み -ウェブインポータを介してウェブから論文レファ…
Mendeleyの解説統合TV作成の計画ですが、前回までのコンテンツ洗い出しを踏まえ、内容が膨らんできたこともあり動画をまたまた基本編/裏技編に分けて作ろうかと計画を直しました。 またその計画に沿って、Mendeleyの動作確認を進めながらの動画筋書きづくり…
定期的に更新、また更新内容をツイートしているこの牧場作業記録。 ツイートのたびにフォロワーの方に読まれているのか？ 拡散されて知らない方にも読んでいただいてるのか？ ということがふと気になり、はてなダイアリーのアクセス解析がないか調べてみたと…
Mendeley使い倒し統合TVで、Mendeley以外の文献管理ツールと比較したときの強みをどのように番組に組み込むか検討中です。【Mendeley】 ○複数のパソコン間での文献ライブラリ共有＆管理できる →組み込み済み ○iOS対応、iPhoneやiPadで使える →tipを付け加え…
Mendeleyの統合TV、使い方紹介に併せてほかの文献管理ツールと比較したときの強みを推し出してやりたい、ということで他の文献管理ツールとの比較を調査途中です。 現段階でまとめ。【Mendeley】 ○複数のパソコン間での文献ライブラリ共有＆管理できる ○iOS…
Mendeleyの基本的な活用方法の調査と、動画の筋書きづくりを以下まで進めました。 [初期設定] -ユーザ登録〜アプリのインストール[文献の追加] -ローカル環境下の論文の取り込み -ウェブインポータを介してウェブから論文レファレンスの取り込み -「Watch Fo…
前回までで組んだMendeley統合TVのコンテンツに沿って具体的な内容を順番に膨らませています。[初期設定] -ユーザ登録〜アプリのインストール[文献の追加] -ローカル環境下の論文の取り込み -ウェブインポータを介してウェブから論文レファレンスの取り込み …
前回からのMendeley調査をそこそこに解説動画の設計に取り掛かっています。 Mendeleyで扱える内容が幅広い、かつ既存のMendeley解説コンテンツの数が多いため、いまのタイミングで何を知りたがっている・どんな人を対象に／何を盛り込んだ動画をつくるか悩む…
次作の統合TVでは文献管理ソフトMendeleyについての動画を作る方針で調査を調べたまとめです。 『Mendeley』でGoogle検索してヒットする日本語ページの結果5ページ分ほど目を通す+αだけで以下のように大量の情報が得られる状況で、どのような番組を作ろうか…
長々と着手していたCueMol2統合TVプロジェクト、7/12・13の2編の動画アップロードをもって完了させました。 「CueMol2でタンパク質の構造を見る 〜応用編・1〜」 「CueMol2でタンパク質の構造を見る 〜応用編・2〜」以前製作した統合TV「CueMol2でタンパク質…
■ “収穫祭”2012年3月16日、ライフサイエンス統合データベースセンター(DBCLS)開催の統合データベース講演会: AJACS本郷12 (第三回統合牧場収穫祭)に参加しました。 当日のTwitter実況の記録は@hkanekaneさんによる収穫祭2012のまとめに(ツイートは一部非・時…
CueMol2の統合TVの応用編の動画編集がだいぶ終盤に差し掛かりました。 計画どおり、放牧あと2〜3回ほどでアップロードできそうです。 ・原子間の距離を測る ・原子間の相互作用を点線で表す ・Object, Renderer, Camera のコピー＆ペースト ・POV-Rayで分子…
またまた前回までに引きつづき、CueMol2の統合TVの応用編の動画編集をしています。 折り返し地点を過ぎたので、放牧あと3〜4回ほどでアップロードまで漕ぎ着けられるのではないかと思います。 当初の予定どおり、3月頭にCueMol2の統合TVプロジェクトを完結の…
前回までに引きつづきCueMol2の統合TVの応用編の動画編集をしています。 これまでに組んだコンテンツに加え新しい項目「POV-Rayで分子モデルをレンダリングする」を追加し、その分の撮影を終え、編集を進めています。 ・原子間の距離を測る ・原子間の相互作…
以下のとおり↓筋書きが完成したCueMol2応用編の統合TV、ひととおり撮影を終えてCamtasiaでの編集に入りました。・原子間の距離を測る ・原子間の相互作用を点線で表す ・Object, Renderer, Camera のコピー＆ペースト ←イマココ、動画時間約4分 ・分子表面の…
統合TV、2011年11月14日のバイオインフォマティクス推進センター（BIRD）第8回研究成果報告会「知識発見への挑戦〜バイオインフォマティクスの飛躍に向けて〜」から、 JSTバイオインフォマティクス推進センター 統括 勝木 元也 先生 による「開会挨拶と私見…
